Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU3

TMEM39B, Transmembrane protein 39B, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39BQ9GZU3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM39BQ9GZU3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms