Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F0

ASXL3, Putative Polycomb group protein ASXL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASXL3Q9C0F0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ASXL3Q9C0F0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ASXL3Q9C0F0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ASXL3Q9C0F0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ASXL3Q9C0F0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ASXL3Q9C0F0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ASXL3Q9C0F0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ASXL3Q9C0F0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ASXL3Q9C0F0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ASXL3Q9C0F0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms