Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
UPF3BQ9BZI7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms