Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NSD3Q9BZ95 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
NSD3Q9BZ95 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NSD3Q9BZ95 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NSD3Q9BZ95 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NSD3Q9BZ95 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NSD3Q9BZ95 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
NSD3Q9BZ95 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NSD3Q9BZ95 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NSD3Q9BZ95 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NSD3Q9BZ95 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NSD3Q9BZ95 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NSD3Q9BZ95 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NSD3Q9BZ95 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NSD3Q9BZ95 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NSD3Q9BZ95 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
NSD3Q9BZ95 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NSD3Q9BZ95 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NSD3Q9BZ95 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NSD3Q9BZ95 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms