Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NIFKQ9BYG3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms