Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SCAPERQ9BY12 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SCAPERQ9BY12 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SCAPERQ9BY12 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SCAPERQ9BY12 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SCAPERQ9BY12 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
SCAPERQ9BY12 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SCAPERQ9BY12 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
SCAPERQ9BY12 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SCAPERQ9BY12 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
SCAPERQ9BY12 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SCAPERQ9BY12 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SCAPERQ9BY12 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SCAPERQ9BY12 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SCAPERQ9BY12 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SCAPERQ9BY12 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SCAPERQ9BY12 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SCAPERQ9BY12 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SCAPERQ9BY12 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SCAPERQ9BY12 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SCAPERQ9BY12 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
SCAPERQ9BY12 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SCAPERQ9BY12 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SCAPERQ9BY12 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
SCAPERQ9BY12 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SCAPERQ9BY12 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
SCAPERQ9BY12 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms