Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS6

NUSAP1, Nucleolar and spindle-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUSAP1Q9BXS6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUSAP1Q9BXS6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUSAP1Q9BXS6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUSAP1Q9BXS6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUSAP1Q9BXS6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUSAP1Q9BXS6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUSAP1Q9BXS6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUSAP1Q9BXS6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUSAP1Q9BXS6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NUSAP1Q9BXS6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUSAP1Q9BXS6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUSAP1Q9BXS6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUSAP1Q9BXS6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUSAP1Q9BXS6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUSAP1Q9BXS6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUSAP1Q9BXS6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUSAP1Q9BXS6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUSAP1Q9BXS6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUSAP1Q9BXS6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUSAP1Q9BXS6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUSAP1Q9BXS6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUSAP1Q9BXS6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUSAP1Q9BXS6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUSAP1Q9BXS6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUSAP1Q9BXS6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUSAP1Q9BXS6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUSAP1Q9BXS6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUSAP1Q9BXS6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUSAP1Q9BXS6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NUSAP1Q9BXS6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUSAP1Q9BXS6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NUSAP1Q9BXS6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NUSAP1Q9BXS6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUSAP1Q9BXS6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUSAP1Q9BXS6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUSAP1Q9BXS6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NUSAP1Q9BXS6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUSAP1Q9BXS6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUSAP1Q9BXS6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUSAP1Q9BXS6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUSAP1Q9BXS6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUSAP1Q9BXS6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUSAP1Q9BXS6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUSAP1Q9BXS6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUSAP1Q9BXS6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NUSAP1Q9BXS6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUSAP1Q9BXS6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUSAP1Q9BXS6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUSAP1Q9BXS6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUSAP1Q9BXS6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUSAP1Q9BXS6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NUSAP1Q9BXS6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NUSAP1Q9BXS6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NUSAP1Q9BXS6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NUSAP1Q9BXS6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUSAP1Q9BXS6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUSAP1Q9BXS6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUSAP1Q9BXS6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUSAP1Q9BXS6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUSAP1Q9BXS6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUSAP1Q9BXS6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUSAP1Q9BXS6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NUSAP1Q9BXS6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUSAP1Q9BXS6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUSAP1Q9BXS6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUSAP1Q9BXS6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUSAP1Q9BXS6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUSAP1Q9BXS6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUSAP1Q9BXS6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NUSAP1Q9BXS6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUSAP1Q9BXS6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUSAP1Q9BXS6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUSAP1Q9BXS6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUSAP1Q9BXS6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUSAP1Q9BXS6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUSAP1Q9BXS6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUSAP1Q9BXS6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUSAP1Q9BXS6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUSAP1Q9BXS6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUSAP1Q9BXS6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUSAP1Q9BXS6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUSAP1Q9BXS6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUSAP1Q9BXS6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUSAP1Q9BXS6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUSAP1Q9BXS6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUSAP1Q9BXS6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NUSAP1Q9BXS6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUSAP1Q9BXS6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NUSAP1Q9BXS6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUSAP1Q9BXS6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUSAP1Q9BXS6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUSAP1Q9BXS6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUSAP1Q9BXS6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUSAP1Q9BXS6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUSAP1Q9BXS6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUSAP1Q9BXS6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUSAP1Q9BXS6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUSAP1Q9BXS6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUSAP1Q9BXS6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUSAP1Q9BXS6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms