Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP2

SLC12A9, Solute carrier family 12 member 9, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A9Q9BXP2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC12A9Q9BXP2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC12A9Q9BXP2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC12A9Q9BXP2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC12A9Q9BXP2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC12A9Q9BXP2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC12A9Q9BXP2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC12A9Q9BXP2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC12A9Q9BXP2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC12A9Q9BXP2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC12A9Q9BXP2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC12A9Q9BXP2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC12A9Q9BXP2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC12A9Q9BXP2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC12A9Q9BXP2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC12A9Q9BXP2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC12A9Q9BXP2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC12A9Q9BXP2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC12A9Q9BXP2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC12A9Q9BXP2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC12A9Q9BXP2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC12A9Q9BXP2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC12A9Q9BXP2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC12A9Q9BXP2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC12A9Q9BXP2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC12A9Q9BXP2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC12A9Q9BXP2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC12A9Q9BXP2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC12A9Q9BXP2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC12A9Q9BXP2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC12A9Q9BXP2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC12A9Q9BXP2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC12A9Q9BXP2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC12A9Q9BXP2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC12A9Q9BXP2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC12A9Q9BXP2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC12A9Q9BXP2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC12A9Q9BXP2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SLC12A9Q9BXP2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SLC12A9Q9BXP2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC12A9Q9BXP2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC12A9Q9BXP2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC12A9Q9BXP2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC12A9Q9BXP2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC12A9Q9BXP2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC12A9Q9BXP2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC12A9Q9BXP2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC12A9Q9BXP2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC12A9Q9BXP2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC12A9Q9BXP2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC12A9Q9BXP2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC12A9Q9BXP2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC12A9Q9BXP2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC12A9Q9BXP2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC12A9Q9BXP2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC12A9Q9BXP2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC12A9Q9BXP2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC12A9Q9BXP2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC12A9Q9BXP2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC12A9Q9BXP2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC12A9Q9BXP2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC12A9Q9BXP2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC12A9Q9BXP2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC12A9Q9BXP2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC12A9Q9BXP2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC12A9Q9BXP2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC12A9Q9BXP2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC12A9Q9BXP2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC12A9Q9BXP2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC12A9Q9BXP2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC12A9Q9BXP2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC12A9Q9BXP2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC12A9Q9BXP2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC12A9Q9BXP2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC12A9Q9BXP2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC12A9Q9BXP2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC12A9Q9BXP2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC12A9Q9BXP2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC12A9Q9BXP2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC12A9Q9BXP2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC12A9Q9BXP2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC12A9Q9BXP2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC12A9Q9BXP2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC12A9Q9BXP2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC12A9Q9BXP2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC12A9Q9BXP2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC12A9Q9BXP2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC12A9Q9BXP2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC12A9Q9BXP2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC12A9Q9BXP2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC12A9Q9BXP2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC12A9Q9BXP2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC12A9Q9BXP2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC12A9Q9BXP2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC12A9Q9BXP2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC12A9Q9BXP2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC12A9Q9BXP2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC12A9Q9BXP2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC12A9Q9BXP2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC12A9Q9BXP2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms