Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VN1R3Q9BXE9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms