Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC94Q9BW85 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms