Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RIOK2Q9BVS4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RIOK2Q9BVS4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms