Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV8

SIKE1, Suppressor of IKBKE 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1Q9BRV8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SIKE1Q9BRV8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SIKE1Q9BRV8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SIKE1Q9BRV8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SIKE1Q9BRV8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SIKE1Q9BRV8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIKE1Q9BRV8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms