Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms