Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
FYCO1Q9BQS8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
FYCO1Q9BQS8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
FYCO1Q9BQS8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
FYCO1Q9BQS8 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
FYCO1Q9BQS8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
FYCO1Q9BQS8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
FYCO1Q9BQS8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
FYCO1Q9BQS8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
FYCO1Q9BQS8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
FYCO1Q9BQS8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC33.12■■■□□ 2.89
FYCO1Q9BQS8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
FYCO1Q9BQS8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
FYCO1Q9BQS8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
FYCO1Q9BQS8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
FYCO1Q9BQS8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
FYCO1Q9BQS8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
FYCO1Q9BQS8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
FYCO1Q9BQS8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
FYCO1Q9BQS8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
FYCO1Q9BQS8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
FYCO1Q9BQS8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
FYCO1Q9BQS8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
FYCO1Q9BQS8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
FYCO1Q9BQS8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
FYCO1Q9BQS8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
FYCO1Q9BQS8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
FYCO1Q9BQS8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
FYCO1Q9BQS8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
FYCO1Q9BQS8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
FYCO1Q9BQS8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
FYCO1Q9BQS8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
FYCO1Q9BQS8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
FYCO1Q9BQS8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
FYCO1Q9BQS8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
FYCO1Q9BQS8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
FYCO1Q9BQS8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
FYCO1Q9BQS8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
FYCO1Q9BQS8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
FYCO1Q9BQS8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
FYCO1Q9BQS8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC33.08■■■□□ 2.89
FYCO1Q9BQS8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
FYCO1Q9BQS8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
FYCO1Q9BQS8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
FYCO1Q9BQS8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
FYCO1Q9BQS8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
FYCO1Q9BQS8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
FYCO1Q9BQS8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
FYCO1Q9BQS8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
FYCO1Q9BQS8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
FYCO1Q9BQS8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
FYCO1Q9BQS8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
FYCO1Q9BQS8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
FYCO1Q9BQS8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
FYCO1Q9BQS8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
FYCO1Q9BQS8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
FYCO1Q9BQS8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
FYCO1Q9BQS8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
FYCO1Q9BQS8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
FYCO1Q9BQS8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
FYCO1Q9BQS8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
FYCO1Q9BQS8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
FYCO1Q9BQS8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
FYCO1Q9BQS8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
FYCO1Q9BQS8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
FYCO1Q9BQS8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
FYCO1Q9BQS8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
FYCO1Q9BQS8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
FYCO1Q9BQS8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
FYCO1Q9BQS8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
FYCO1Q9BQS8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
FYCO1Q9BQS8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
FYCO1Q9BQS8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
FYCO1Q9BQS8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
FYCO1Q9BQS8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
FYCO1Q9BQS8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
FYCO1Q9BQS8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
FYCO1Q9BQS8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
FYCO1Q9BQS8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
FYCO1Q9BQS8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
FYCO1Q9BQS8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
FYCO1Q9BQS8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
FYCO1Q9BQS8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
FYCO1Q9BQS8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
FYCO1Q9BQS8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
FYCO1Q9BQS8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
FYCO1Q9BQS8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
FYCO1Q9BQS8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
FYCO1Q9BQS8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
FYCO1Q9BQS8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
FYCO1Q9BQS8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
FYCO1Q9BQS8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
FYCO1Q9BQS8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
FYCO1Q9BQS8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
FYCO1Q9BQS8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
FYCO1Q9BQS8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
FYCO1Q9BQS8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
FYCO1Q9BQS8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
FYCO1Q9BQS8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
FYCO1Q9BQS8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms