Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USB1Q9BQ65 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
USB1Q9BQ65 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
USB1Q9BQ65 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USB1Q9BQ65 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USB1Q9BQ65 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USB1Q9BQ65 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USB1Q9BQ65 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USB1Q9BQ65 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USB1Q9BQ65 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USB1Q9BQ65 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USB1Q9BQ65 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USB1Q9BQ65 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USB1Q9BQ65 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
USB1Q9BQ65 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms