Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TREX2Q9BQ50 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TREX2Q9BQ50 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TREX2Q9BQ50 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
TREX2Q9BQ50 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TREX2Q9BQ50 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TREX2Q9BQ50 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TREX2Q9BQ50 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TREX2Q9BQ50 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TREX2Q9BQ50 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TREX2Q9BQ50 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TREX2Q9BQ50 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TREX2Q9BQ50 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TREX2Q9BQ50 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TREX2Q9BQ50 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms