Protein–RNA interactions for Protein: Q99999

GAL3ST1, Galactosylceramide sulfotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAL3ST1Q99999 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GAL3ST1Q99999 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms