Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CITED1Q99966 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms