Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms