Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
RGPD5Q99666 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RGPD5Q99666 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD5Q99666 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD5Q99666 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD5Q99666 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD5Q99666 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD5Q99666 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD5Q99666 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD5Q99666 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD5Q99666 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD5Q99666 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD5Q99666 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD5Q99666 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD5Q99666 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD5Q99666 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms