Protein–RNA interactions for Protein: Q99618

CDCA3, Cell division cycle-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3Q99618 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDCA3Q99618 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDCA3Q99618 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDCA3Q99618 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDCA3Q99618 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CDCA3Q99618 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDCA3Q99618 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDCA3Q99618 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDCA3Q99618 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDCA3Q99618 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDCA3Q99618 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDCA3Q99618 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDCA3Q99618 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDCA3Q99618 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDCA3Q99618 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDCA3Q99618 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDCA3Q99618 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDCA3Q99618 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDCA3Q99618 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CDCA3Q99618 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDCA3Q99618 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDCA3Q99618 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDCA3Q99618 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDCA3Q99618 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDCA3Q99618 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDCA3Q99618 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CDCA3Q99618 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CDCA3Q99618 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDCA3Q99618 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDCA3Q99618 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDCA3Q99618 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDCA3Q99618 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDCA3Q99618 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDCA3Q99618 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDCA3Q99618 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CDCA3Q99618 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDCA3Q99618 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDCA3Q99618 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDCA3Q99618 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDCA3Q99618 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDCA3Q99618 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDCA3Q99618 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CDCA3Q99618 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDCA3Q99618 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDCA3Q99618 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CDCA3Q99618 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms