Protein–RNA interactions for Protein: Q99502

EYA1, Eyes absent homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA1Q99502 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EYA1Q99502 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EYA1Q99502 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EYA1Q99502 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EYA1Q99502 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EYA1Q99502 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EYA1Q99502 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EYA1Q99502 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EYA1Q99502 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EYA1Q99502 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EYA1Q99502 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EYA1Q99502 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EYA1Q99502 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EYA1Q99502 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EYA1Q99502 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EYA1Q99502 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EYA1Q99502 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EYA1Q99502 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EYA1Q99502 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EYA1Q99502 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EYA1Q99502 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EYA1Q99502 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EYA1Q99502 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EYA1Q99502 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EYA1Q99502 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EYA1Q99502 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EYA1Q99502 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EYA1Q99502 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EYA1Q99502 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EYA1Q99502 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EYA1Q99502 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EYA1Q99502 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EYA1Q99502 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
EYA1Q99502 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
EYA1Q99502 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
EYA1Q99502 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EYA1Q99502 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EYA1Q99502 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EYA1Q99502 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EYA1Q99502 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EYA1Q99502 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EYA1Q99502 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EYA1Q99502 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EYA1Q99502 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EYA1Q99502 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EYA1Q99502 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EYA1Q99502 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EYA1Q99502 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EYA1Q99502 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
EYA1Q99502 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EYA1Q99502 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EYA1Q99502 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EYA1Q99502 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EYA1Q99502 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EYA1Q99502 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EYA1Q99502 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EYA1Q99502 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EYA1Q99502 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EYA1Q99502 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EYA1Q99502 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EYA1Q99502 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EYA1Q99502 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EYA1Q99502 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EYA1Q99502 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EYA1Q99502 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EYA1Q99502 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
EYA1Q99502 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC28■■■□□ 2.07
EYA1Q99502 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC28■■■□□ 2.07
EYA1Q99502 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC28■■■□□ 2.07
EYA1Q99502 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
EYA1Q99502 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EYA1Q99502 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EYA1Q99502 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EYA1Q99502 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EYA1Q99502 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EYA1Q99502 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EYA1Q99502 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EYA1Q99502 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
EYA1Q99502 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
EYA1Q99502 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EYA1Q99502 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EYA1Q99502 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EYA1Q99502 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EYA1Q99502 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EYA1Q99502 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EYA1Q99502 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EYA1Q99502 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EYA1Q99502 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EYA1Q99502 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EYA1Q99502 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EYA1Q99502 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms