Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NOTCH4Q99466 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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