Protein–RNA interactions for Protein: Q99456

KRT12, Keratin, type I cytoskeletal 12, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT12Q99456 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT12Q99456 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms