Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SIN3AQ96ST3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SIN3AQ96ST3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SIN3AQ96ST3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SIN3AQ96ST3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SIN3AQ96ST3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SIN3AQ96ST3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SIN3AQ96ST3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SIN3AQ96ST3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SIN3AQ96ST3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SIN3AQ96ST3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SIN3AQ96ST3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SIN3AQ96ST3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
SIN3AQ96ST3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
SIN3AQ96ST3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SIN3AQ96ST3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SIN3AQ96ST3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SIN3AQ96ST3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SIN3AQ96ST3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SIN3AQ96ST3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SIN3AQ96ST3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SIN3AQ96ST3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SIN3AQ96ST3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SIN3AQ96ST3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SIN3AQ96ST3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SIN3AQ96ST3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SIN3AQ96ST3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SIN3AQ96ST3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SIN3AQ96ST3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SIN3AQ96ST3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SIN3AQ96ST3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SIN3AQ96ST3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SIN3AQ96ST3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SIN3AQ96ST3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SIN3AQ96ST3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SIN3AQ96ST3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SIN3AQ96ST3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SIN3AQ96ST3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SIN3AQ96ST3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SIN3AQ96ST3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SIN3AQ96ST3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SIN3AQ96ST3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SIN3AQ96ST3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SIN3AQ96ST3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SIN3AQ96ST3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SIN3AQ96ST3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SIN3AQ96ST3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
SIN3AQ96ST3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SIN3AQ96ST3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SIN3AQ96ST3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SIN3AQ96ST3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SIN3AQ96ST3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SIN3AQ96ST3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SIN3AQ96ST3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SIN3AQ96ST3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SIN3AQ96ST3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SIN3AQ96ST3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SIN3AQ96ST3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
SIN3AQ96ST3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
SIN3AQ96ST3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
SIN3AQ96ST3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SIN3AQ96ST3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
SIN3AQ96ST3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SIN3AQ96ST3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SIN3AQ96ST3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
SIN3AQ96ST3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SIN3AQ96ST3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SIN3AQ96ST3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SIN3AQ96ST3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SIN3AQ96ST3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SIN3AQ96ST3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SIN3AQ96ST3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SIN3AQ96ST3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SIN3AQ96ST3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SIN3AQ96ST3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SIN3AQ96ST3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
SIN3AQ96ST3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SIN3AQ96ST3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SIN3AQ96ST3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SIN3AQ96ST3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SIN3AQ96ST3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SIN3AQ96ST3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SIN3AQ96ST3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SIN3AQ96ST3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SIN3AQ96ST3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SIN3AQ96ST3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SIN3AQ96ST3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
SIN3AQ96ST3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SIN3AQ96ST3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SIN3AQ96ST3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SIN3AQ96ST3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SIN3AQ96ST3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SIN3AQ96ST3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SIN3AQ96ST3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SIN3AQ96ST3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SIN3AQ96ST3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SIN3AQ96ST3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SIN3AQ96ST3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SIN3AQ96ST3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SIN3AQ96ST3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms