Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
LMTK3Q96Q04 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
LMTK3Q96Q04 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
LMTK3Q96Q04 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
LMTK3Q96Q04 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
LMTK3Q96Q04 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
LMTK3Q96Q04 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
LMTK3Q96Q04 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
LMTK3Q96Q04 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC30.89■■■□□ 2.54
LMTK3Q96Q04 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
LMTK3Q96Q04 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
LMTK3Q96Q04 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
LMTK3Q96Q04 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
LMTK3Q96Q04 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC30.89■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC30.82■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
LMTK3Q96Q04 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
LMTK3Q96Q04 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
LMTK3Q96Q04 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
LMTK3Q96Q04 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
LMTK3Q96Q04 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
LMTK3Q96Q04 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
LMTK3Q96Q04 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
LMTK3Q96Q04 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
LMTK3Q96Q04 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
LMTK3Q96Q04 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
LMTK3Q96Q04 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
LMTK3Q96Q04 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
LMTK3Q96Q04 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
LMTK3Q96Q04 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms