Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NSMCE2Q96MF7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NSMCE2Q96MF7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NSMCE2Q96MF7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NSMCE2Q96MF7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NSMCE2Q96MF7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NSMCE2Q96MF7 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NSMCE2Q96MF7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NSMCE2Q96MF7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NSMCE2Q96MF7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NSMCE2Q96MF7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NSMCE2Q96MF7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NSMCE2Q96MF7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NSMCE2Q96MF7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NSMCE2Q96MF7 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NSMCE2Q96MF7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NSMCE2Q96MF7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NSMCE2Q96MF7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NSMCE2Q96MF7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NSMCE2Q96MF7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NSMCE2Q96MF7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NSMCE2Q96MF7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NSMCE2Q96MF7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NSMCE2Q96MF7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NSMCE2Q96MF7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NSMCE2Q96MF7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NSMCE2Q96MF7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NSMCE2Q96MF7 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NSMCE2Q96MF7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NSMCE2Q96MF7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NSMCE2Q96MF7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NSMCE2Q96MF7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NSMCE2Q96MF7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NSMCE2Q96MF7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NSMCE2Q96MF7 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NSMCE2Q96MF7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NSMCE2Q96MF7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NSMCE2Q96MF7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NSMCE2Q96MF7 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NSMCE2Q96MF7 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NSMCE2Q96MF7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NSMCE2Q96MF7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NSMCE2Q96MF7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NSMCE2Q96MF7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NSMCE2Q96MF7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NSMCE2Q96MF7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NSMCE2Q96MF7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NSMCE2Q96MF7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NSMCE2Q96MF7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NSMCE2Q96MF7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NSMCE2Q96MF7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NSMCE2Q96MF7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NSMCE2Q96MF7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms