Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FGD4Q96M96 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms