Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CFAP53Q96M91 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CFAP53Q96M91 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CFAP53Q96M91 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFAP53Q96M91 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms