Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
FAM227BQ96M60 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms