Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms