Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ZBED3Q96IU2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZBED3Q96IU2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
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