Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms