Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT7

ASIC4, Acid-sensing ion channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC4Q96FT7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ASIC4Q96FT7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ASIC4Q96FT7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ASIC4Q96FT7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASIC4Q96FT7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASIC4Q96FT7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASIC4Q96FT7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASIC4Q96FT7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ASIC4Q96FT7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASIC4Q96FT7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASIC4Q96FT7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASIC4Q96FT7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ASIC4Q96FT7 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASIC4Q96FT7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASIC4Q96FT7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASIC4Q96FT7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASIC4Q96FT7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASIC4Q96FT7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASIC4Q96FT7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASIC4Q96FT7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASIC4Q96FT7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASIC4Q96FT7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASIC4Q96FT7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASIC4Q96FT7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASIC4Q96FT7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms