Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms