Protein–RNA interactions for Protein: Q96CT2

KLHL29, Kelch-like protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL29Q96CT2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL29Q96CT2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms