Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG3

TIFA, TRAF-interacting protein with FHA domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIFAQ96CG3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TIFAQ96CG3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TIFAQ96CG3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TIFAQ96CG3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TIFAQ96CG3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TIFAQ96CG3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TIFAQ96CG3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TIFAQ96CG3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TIFAQ96CG3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TIFAQ96CG3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TIFAQ96CG3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TIFAQ96CG3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TIFAQ96CG3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TIFAQ96CG3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TIFAQ96CG3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TIFAQ96CG3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TIFAQ96CG3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TIFAQ96CG3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TIFAQ96CG3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TIFAQ96CG3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TIFAQ96CG3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TIFAQ96CG3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TIFAQ96CG3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TIFAQ96CG3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TIFAQ96CG3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TIFAQ96CG3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TIFAQ96CG3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TIFAQ96CG3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TIFAQ96CG3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TIFAQ96CG3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TIFAQ96CG3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TIFAQ96CG3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TIFAQ96CG3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TIFAQ96CG3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TIFAQ96CG3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TIFAQ96CG3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TIFAQ96CG3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TIFAQ96CG3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TIFAQ96CG3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TIFAQ96CG3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TIFAQ96CG3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TIFAQ96CG3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TIFAQ96CG3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TIFAQ96CG3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TIFAQ96CG3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TIFAQ96CG3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TIFAQ96CG3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TIFAQ96CG3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TIFAQ96CG3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TIFAQ96CG3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TIFAQ96CG3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TIFAQ96CG3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIFAQ96CG3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms