Protein–RNA interactions for Protein: Q969V6

MKL1, MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1Q969V6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKL1Q969V6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKL1Q969V6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKL1Q969V6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKL1Q969V6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MKL1Q969V6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MKL1Q969V6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKL1Q969V6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKL1Q969V6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKL1Q969V6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKL1Q969V6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKL1Q969V6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MKL1Q969V6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MKL1Q969V6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MKL1Q969V6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MKL1Q969V6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MKL1Q969V6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MKL1Q969V6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MKL1Q969V6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MKL1Q969V6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MKL1Q969V6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MKL1Q969V6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MKL1Q969V6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MKL1Q969V6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MKL1Q969V6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MKL1Q969V6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MKL1Q969V6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MKL1Q969V6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MKL1Q969V6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MKL1Q969V6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MKL1Q969V6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MKL1Q969V6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MKL1Q969V6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MKL1Q969V6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MKL1Q969V6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MKL1Q969V6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MKL1Q969V6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MKL1Q969V6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MKL1Q969V6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MKL1Q969V6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MKL1Q969V6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MKL1Q969V6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MKL1Q969V6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MKL1Q969V6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MKL1Q969V6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MKL1Q969V6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MKL1Q969V6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MKL1Q969V6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MKL1Q969V6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MKL1Q969V6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MKL1Q969V6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MKL1Q969V6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MKL1Q969V6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MKL1Q969V6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MKL1Q969V6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MKL1Q969V6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MKL1Q969V6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MKL1Q969V6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MKL1Q969V6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MKL1Q969V6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MKL1Q969V6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MKL1Q969V6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MKL1Q969V6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MKL1Q969V6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MKL1Q969V6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MKL1Q969V6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms