Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms