Protein–RNA interactions for Protein: Q93038

TNFRSF25, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 25, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25Q93038 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNFRSF25Q93038 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms