Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PRG4Q92954 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PRG4Q92954 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PRG4Q92954 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PRG4Q92954 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PRG4Q92954 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PRG4Q92954 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PRG4Q92954 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PRG4Q92954 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PRG4Q92954 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PRG4Q92954 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PRG4Q92954 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PRG4Q92954 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PRG4Q92954 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PRG4Q92954 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PRG4Q92954 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PRG4Q92954 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PRG4Q92954 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PRG4Q92954 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PRG4Q92954 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
PRG4Q92954 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PRG4Q92954 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PRG4Q92954 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PRG4Q92954 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PRG4Q92954 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PRG4Q92954 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PRG4Q92954 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PRG4Q92954 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PRG4Q92954 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PRG4Q92954 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
PRG4Q92954 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PRG4Q92954 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PRG4Q92954 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PRG4Q92954 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PRG4Q92954 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PRG4Q92954 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PRG4Q92954 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PRG4Q92954 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PRG4Q92954 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PRG4Q92954 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PRG4Q92954 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PRG4Q92954 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PRG4Q92954 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PRG4Q92954 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PRG4Q92954 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PRG4Q92954 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PRG4Q92954 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PRG4Q92954 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PRG4Q92954 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PRG4Q92954 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PRG4Q92954 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PRG4Q92954 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PRG4Q92954 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PRG4Q92954 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PRG4Q92954 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PRG4Q92954 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PRG4Q92954 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PRG4Q92954 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PRG4Q92954 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PRG4Q92954 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PRG4Q92954 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PRG4Q92954 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PRG4Q92954 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PRG4Q92954 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PRG4Q92954 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PRG4Q92954 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PRG4Q92954 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PRG4Q92954 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PRG4Q92954 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PRG4Q92954 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PRG4Q92954 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PRG4Q92954 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PRG4Q92954 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PRG4Q92954 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PRG4Q92954 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PRG4Q92954 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PRG4Q92954 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PRG4Q92954 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PRG4Q92954 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PRG4Q92954 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PRG4Q92954 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PRG4Q92954 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PRG4Q92954 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PRG4Q92954 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PRG4Q92954 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PRG4Q92954 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PRG4Q92954 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PRG4Q92954 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PRG4Q92954 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PRG4Q92954 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PRG4Q92954 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PRG4Q92954 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PRG4Q92954 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
PRG4Q92954 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PRG4Q92954 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PRG4Q92954 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PRG4Q92954 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
PRG4Q92954 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PRG4Q92954 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
PRG4Q92954 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms