Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RABGGTAQ92696 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
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