Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
PHF3Q92576 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF3Q92576 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF3Q92576 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF3Q92576 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF3Q92576 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF3Q92576 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF3Q92576 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF3Q92576 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF3Q92576 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF3Q92576 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF3Q92576 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF3Q92576 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF3Q92576 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF3Q92576 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF3Q92576 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF3Q92576 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF3Q92576 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF3Q92576 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF3Q92576 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF3Q92576 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF3Q92576 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF3Q92576 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF3Q92576 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF3Q92576 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF3Q92576 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF3Q92576 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF3Q92576 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF3Q92576 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF3Q92576 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF3Q92576 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms