Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZA2

RAPGEF4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF4Q8WZA2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAPGEF4Q8WZA2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAPGEF4Q8WZA2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAPGEF4Q8WZA2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAPGEF4Q8WZA2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAPGEF4Q8WZA2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAPGEF4Q8WZA2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAPGEF4Q8WZA2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAPGEF4Q8WZA2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAPGEF4Q8WZA2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAPGEF4Q8WZA2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAPGEF4Q8WZA2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAPGEF4Q8WZA2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
RAPGEF4Q8WZA2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
RAPGEF4Q8WZA2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAPGEF4Q8WZA2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAPGEF4Q8WZA2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAPGEF4Q8WZA2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAPGEF4Q8WZA2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAPGEF4Q8WZA2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAPGEF4Q8WZA2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms