Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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