Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWL2

SPIRE2, Protein spire homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE2Q8WWL2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SPIRE2Q8WWL2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPIRE2Q8WWL2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPIRE2Q8WWL2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPIRE2Q8WWL2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPIRE2Q8WWL2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPIRE2Q8WWL2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPIRE2Q8WWL2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPIRE2Q8WWL2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPIRE2Q8WWL2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPIRE2Q8WWL2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPIRE2Q8WWL2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPIRE2Q8WWL2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPIRE2Q8WWL2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SPIRE2Q8WWL2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms