Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF1

C1orf54, Uncharacterized protein C1orf54, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf54Q8WWF1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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