Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC107Q8WV48 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms