Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
TRIM41Q8WV44 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
TRIM41Q8WV44 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
TRIM41Q8WV44 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
TRIM41Q8WV44 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
TRIM41Q8WV44 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
TRIM41Q8WV44 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
TRIM41Q8WV44 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
TRIM41Q8WV44 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
TRIM41Q8WV44 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
TRIM41Q8WV44 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
TRIM41Q8WV44 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
TRIM41Q8WV44 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
TRIM41Q8WV44 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
TRIM41Q8WV44 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC36.32■■■■□ 3.41
TRIM41Q8WV44 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
TRIM41Q8WV44 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
TRIM41Q8WV44 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
TRIM41Q8WV44 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
TRIM41Q8WV44 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
TRIM41Q8WV44 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
TRIM41Q8WV44 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
TRIM41Q8WV44 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
TRIM41Q8WV44 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
TRIM41Q8WV44 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
TRIM41Q8WV44 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
TRIM41Q8WV44 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
TRIM41Q8WV44 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
TRIM41Q8WV44 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
TRIM41Q8WV44 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
TRIM41Q8WV44 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
TRIM41Q8WV44 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
TRIM41Q8WV44 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
TRIM41Q8WV44 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
TRIM41Q8WV44 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
TRIM41Q8WV44 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
TRIM41Q8WV44 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
TRIM41Q8WV44 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
TRIM41Q8WV44 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
TRIM41Q8WV44 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
TRIM41Q8WV44 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
TRIM41Q8WV44 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
TRIM41Q8WV44 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
TRIM41Q8WV44 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
TRIM41Q8WV44 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
TRIM41Q8WV44 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC36.29■■■■□ 3.4
TRIM41Q8WV44 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
TRIM41Q8WV44 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
TRIM41Q8WV44 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
TRIM41Q8WV44 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
TRIM41Q8WV44 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
TRIM41Q8WV44 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
TRIM41Q8WV44 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
TRIM41Q8WV44 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
TRIM41Q8WV44 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
TRIM41Q8WV44 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
TRIM41Q8WV44 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
TRIM41Q8WV44 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
TRIM41Q8WV44 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
TRIM41Q8WV44 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
TRIM41Q8WV44 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
TRIM41Q8WV44 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
TRIM41Q8WV44 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
TRIM41Q8WV44 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
TRIM41Q8WV44 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
TRIM41Q8WV44 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
TRIM41Q8WV44 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
TRIM41Q8WV44 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
TRIM41Q8WV44 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC36.27■■■■□ 3.4
TRIM41Q8WV44 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
TRIM41Q8WV44 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
TRIM41Q8WV44 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
TRIM41Q8WV44 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
TRIM41Q8WV44 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
TRIM41Q8WV44 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
TRIM41Q8WV44 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
TRIM41Q8WV44 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
TRIM41Q8WV44 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
TRIM41Q8WV44 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
TRIM41Q8WV44 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
TRIM41Q8WV44 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
TRIM41Q8WV44 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
TRIM41Q8WV44 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
TRIM41Q8WV44 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
TRIM41Q8WV44 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
TRIM41Q8WV44 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
TRIM41Q8WV44 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
TRIM41Q8WV44 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
TRIM41Q8WV44 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
TRIM41Q8WV44 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
TRIM41Q8WV44 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
TRIM41Q8WV44 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
TRIM41Q8WV44 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
TRIM41Q8WV44 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
TRIM41Q8WV44 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
TRIM41Q8WV44 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
TRIM41Q8WV44 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
TRIM41Q8WV44 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
TRIM41Q8WV44 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
TRIM41Q8WV44 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms