Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms